Нукэнин (яп.  抜け忍 досл. «Беглый ниндзя») — шиноби, покинувший свою собственную деревню, часто по причине совершения им определённых преступлений. Ниндзя этого класса часто фигурируют в Книге Бинго (яп. 手配書 Бинго-Букку, досл. «поисковые инструкции»), списке врагов для их убийства, который имеет каждая деревня для пользования дзёнинами и членами АНБУ. Иногда очень сильных нукэнинов, таких как Саске Учиха , Итачи Учиха и Кисаме Хошигаки, называют ниндзя S-уровня. Нукэнины зачастую носят повязку ниндзя собственной деревни, но с перечёркнутым горизонтальной линией символом селения.